後藤です．
＃少々時間があきましたが．
> このメッセージが出ると言うことは、*.xmlファイルに
> <initrd path="minirtcl.gz" />
> が残っているんじゃないでしょうか。
> 上のメッセージは、coLinuxフォルダにあるminirtcl.gz の中のlinuxrc
> が、cloopファイルKNOPPIXを見つけられない時に出すものなので。
とのことで，KNOPPIX v3.7最新版ではcoLinuxも20041024へアップデート
していますので，この最新版環境で試してみました．
＃ご指摘をもとに，今回はinitrd指定はminirtclではありません．
以下，設定と結果の概要です．
■XMLファイル（抜粋）
<block_device index="1" alias="hda3"
path="\Device\Harddisk0\Partition3" enabled="true" />
注釈）ハードディスクの３つめのパーティションにKNOPPIXを
インストールしています．デュアルブートも可です．
パーティションは環境に応じて変更してください．
<bootparams>root=/dev/hda3 lang=ja 3 vga=normal
noscsi nodhcp nopcmcia nousb noagp dma noapm xserver=Xnest
</bootparams>
注釈）aliasで指定したパーティションをroot指定します．
<initrd path="initrd.gz" />
注釈）colinuxインストーラについているinitrdを指定．
■ネット設定
・/dev/hda3にインストールしたKNOPPIXのIPアドレスと，
coLinuxを起動するWin環境のIPアドレスを別の値を設定します．
（同一ネット内の別ホストとして扱います）
・Winのネットプロパティにて，TAP I/FとNICをブリッジ接続します．
・coLinuxの起動バッチファイルにて，KNOPPIXへ割り当てたIPアドレス
に対してxhostで許可設定します．
■実行結果
・coLinuxをバッチファイルで起動すると，ハードディスク（/dev/hda3)
をマウントしてKNOPPIXが起動し，コンソールでのログインプロンプトが
現れます．XMLの設定ではGUIログインも可かもしれませんが未確認です．
・ここでログインし，xterm -display 192.168.0.1:0.0 のようにWin環境の
IPアドレスをdisplay指定するとCygwin/X上にxtermが現れます．
・coLinux環境（/dev/hda3上のKNOPPIX環境）でapacheを起動するように
しておくと，Win環境のブラウザからそのHPを見ることができますので，
ちょっとしたテストなどにも使えます．
■余談
・通常「デュアルブート」では，WinとLinuxなど複数のOSをインストールし，
「どちらか片方を選択して」起動していますが，この設定＆方法では，
ハードディスク上のWinとKnoppixを「両方同時に」起動できます．
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