[knoppix:5535] Re: KN OPPIX3.8.2で MPIの処理速度が低下

> 天野です。
> 
> >こんにちは
> >
> >KNOPPIX3.8.2でMPIを使った並列処理を行おうとしているのですが，並列処理の
> >処理速度が異常に遅くて困っています．
> >同環境でKNOPPIX3.3での処理速度は遅くはないのですがKNOPPIX3.8.2では処理速
> >度が激減します．
> >原因はKernelのバージョンが2.4から2.6に更新されていることかと考えているの
> >ですが，本当の所はよく分かりません．
> >なにか原因が思いつく方はお知らせください．
> >  
> >
> kernelに原因があるかは解からなくても、ネットワークの通信に問題があるのか、
> シングルマシンですでに問題があるのかは、テストすればすぐに解かると思い
ます。
> まず、テストをされてはどうでしょう。
> 
> それに、本当にMPIだけの問題なのでしょうか。MPIを利用しない、
> ネットワーク、ディスクアクセス等のテストは行いましたか。
> 
> MPIを利用している知人はいますが、2.6が遅いということはないそうです。
> ということは、ディストリビューションを選んだり、再構築したり、
> といった程度でパフォーマンスを上げることが出来ると思います。
> 

お返事ありがとうございます．
ネットワークやシングルマシンのテストはすでに行っていて，これらについては
スペックは以下に示すとおりで，MPIによる並列処理を行う上で問題はないです．
ネットワーク　：100Mbps（100Mbps対応のスイッチを介したスター型ネット
ワーク）

PC　:CPU=1.9GHz, Memory=512MB

今回並列処理システムを構築するに当たって私はKernel2.6.11のKNOPPIX3.8.2を
再構築しました．
今回私はMPICH，rsh，xinetdをaptでインストールして，/etc/hostsや
/etc/network/interfaces等の設定ファイルを設定して並列システム用に再構築
しました．

このシステムは同様の環境，設定でKernel2.4のKNOPPIX3.3を再構築して作った
並列処理システムに比べ計算時間が約6倍増しと，明らかに遅い結果になりました．
当初は高速な計算が可能なKernel2.4のKNOPPIX3.3で並列処理を行おうと考えて
いたのですが今回のPC環境ではKernel2.4では起動することが出来ないので
Kernel2.6のKNOPPIX3.9でシステムを構築しました．

天野さんの知人の方はKernel2.6でMPIを動かせているのでKernel2.6に問題はな
いようですね．

うーん何が問題なのか検討がつきません．
また何かお気づきの点がありましたらお知らせいただきたいです．