Vitruvian Penguin
knoppix

[knoppix:2390] Re: KNOPPIX-RW

Date: Thu, 11 Dec 2003 05:17:36 +0000
X-mailer: Sylpheed version 0.7.3 (GTK+ 1.2.10; i386-redhat-linux)
南島さま

On Thu, 11 Dec 2003 00:39:11 +0900
Koichi Minamijima <minamijima@xxxxxxxxxxx> wrote:

> 天野様
> 
> 始めまして、マホレックスの南島です。
はじめまして。天野と申します。

> 
> > 私も、自作のバイオ系のツールを載せたものを作ってみたいと思っているんですよね...。
> 
> どういったツールでしょうか?
> フリーで配って良いものであれば、検討させて下さい。
> # こうゆうのが増えてくると面白くなりそうです。
まず、"必要だけど、作るのめんどくさい。誰か作ってないのか?"
的なものですと、http://150.26.237.19/にあるのですが、
自分が外からも取れるようにするのが目的なので、うそついてたりします。
たしか、動かないのまであったと思いますが、自由に使って頂ければ幸いです。

#ほとんどが、100行以下のプログラムです。
#すみません、今は忙しいので、一段落したら、メンテナンスします。

> 
> > それで、本題ですが、マホレックスさんにお尋ねします。
> > 今週末から、パシフィコ横浜でGIWが開催されますが、出展なさいますか。
> > 私はポスター発表をするのですが、もし良ければ、会場でお会いしませんか?
> 
> すいません。
> 出展の予定は特にありません。
> そちらでは自作ツールの紹介があるのですか?
そして、もうひとつ、Self-Organizing Clusteringという
ツールを開発中であり、今回GIWで発表いたします。
アルゴリズムとしては、最適配置アルゴリズムと言うのでしょうか?
私も良く分からないのですが、K-meansみたいなもの?です。
非階層クラスタリングツールです。

こちらは、まだ開発中なので、すぐにお出しすることはできませんが、
前のバージョンならば、GIWが終ってから、お送りしても構いません。
パッケージ全部で2000行程度、アルゴリズム固有の部分だけだと、
300-400行くらい?でしょうか。CとPerlです。
こちらも、自由に使って下さい。

#bioinformatics分野は、これだ!といったのを
#見付けるのが難しいですね。
#ほとんどがフリーと言うのは非常にありがたいですが。
#私は普段、プログラミング等しないのですが、
#結局、自分で作らざるを得なかったりします。

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