天野です。
On Tue, 11 May 2004 12:21:54 +0900
Hirano Kazunari <wx2k-hrn@xxxxxxxxxxxxxxx> wrote:
> ありがとうございます。
>
> kamano wrote:
>
> >SUNのGridEngineはLinuxにも移植されているので、
> >GridEngine入りのKnoppixでPCをクラスタ化するということでは?
> >#というのは書いてある通りなので、
> >#質問の意図は、そんなことをするメリットは?
> >#ということなのでしょうか?
> >
> >
> そのとおりです。：） なにか良いことがあるのかしらん。
> どんなことに使うと便利なのかなあ、といったことです。：）
Knoppixにしてみれば、便利なツールがひとつ増えた、と言うことになりますが、
Gridあるいはクラスター側から見たときのメリットは良くわかりませんね
(より、セキュアだということかな?)。まあ、セミナーでは、このへんの
説明があるのだと思います。
>
> >#ちなみにGridEngine評判良いです
> >#(私の周りでは)。
> >
> >
> どんなところで、どのように使われているのでしょうか？
私は使ってませんが(ハードウエアへの投資金がないので)、
Blastという、DNAやたんぱくの相同性検索を行うツールを
GridEngineで動かしている例があります。
BlastもMPI-Blastがあるのですが、あまり良くできていないらしく、
"GridEngineのほうが賢い"のだそうです。
#Blast自体、あんまり信用できないって話もありますが...。
#まあ、でも、クローンやホモログ探しのひとつの手段ですから。
ん? となると、KNOBに入れてもよさそうじゃないですか?
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