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knoppix

[knoppix:3270] Re: KnoppixCDを使ったGrid実践

Date: Tue, 11 May 2004 19:53:39 +0900 (JST)
X-mailer: Mew version 2.2 on Emacs 21.2 / Mule 5.0 (SAKAKI)
須崎です。

 >>From: kamano <kamano@xxxxxxxxxxx>
 >>Subject: [knoppix:3264] Re: KnoppixCDを使ったGrid実践
 >>
 >>天野です。
 >>
 >>> どんなところで、どのように使われているのでしょうか?
 >>私は使ってませんが(ハードウエアへの投資金がないので)、
 >>Blastという、DNAやたんぱくの相同性検索を行うツールを
 >>GridEngineで動かしている例があります。
 >>BlastもMPI-Blastがあるのですが、あまり良くできていないらしく、
 >>"GridEngineのほうが賢い"のだそうです。
 >>
 >>ん? となると、KNOBに入れてもよさそうじゃないですか?

類似の例では BioInfmatics 用の KNOPPIX である VigyaanCD は OpenMoix を
入れていました。Blast も入っています。
   http://www.vigyaancd.org/

OpenMosix は Single System Image を得られるソフトウェアです。簡単に言
うと SMP マシン風に使えます。並列化を行なわなくても負荷の状況によって
プロセスが他のマシンで実行されます。ClusterKNOPPIX でも OpenMosix が使
われていました。
   http://openmosix.sourceforge.net/
   http://bofh.be/clusterknoppix/

性能や使い勝手がどちらが言いのか判りませんが、選択肢の一つですよね。

そう言えば、flashmobs comuting では何を使っていたのだろう?
性能比較の情報があるとありがたいですね。
# NSUG でも同様の試みがあるけど、成果を知りたいですね。

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suzaki
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