須崎です。
>>From: kamano <kamano@xxxxxxxxxxx>
>>Subject: [knoppix:3264] Re: KnoppixCDを使ったGrid実践
>>
>>天野です。
>>
>>> どんなところで、どのように使われているのでしょうか?
>>私は使ってませんが(ハードウエアへの投資金がないので)、
>>Blastという、DNAやたんぱくの相同性検索を行うツールを
>>GridEngineで動かしている例があります。
>>BlastもMPI-Blastがあるのですが、あまり良くできていないらしく、
>>"GridEngineのほうが賢い"のだそうです。
>>
>>ん? となると、KNOBに入れてもよさそうじゃないですか?
類似の例では BioInfmatics 用の KNOPPIX である VigyaanCD は OpenMoix を
入れていました。Blast も入っています。
http://www.vigyaancd.org/
OpenMosix は Single System Image を得られるソフトウェアです。簡単に言
うと SMP マシン風に使えます。並列化を行なわなくても負荷の状況によって
プロセスが他のマシンで実行されます。ClusterKNOPPIX でも OpenMosix が使
われていました。
http://openmosix.sourceforge.net/
http://bofh.be/clusterknoppix/
性能や使い勝手がどちらが言いのか判りませんが、選択肢の一つですよね。
そう言えば、flashmobs comuting では何を使っていたのだろう?
性能比較の情報があるとありがたいですね。
# NSUG でも同様の試みがあるけど、成果を知りたいですね。
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suzaki
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