小西です。
アナウンスしてから、なんですが、現在理研の横浜は計画停電の為に
全ての計算機が停止しております。明日の午後には再開できるはずですので、
後ほど再アナウンスさせていただきます。
> -----Original Message-----
> From: post-01082104-fumikazu=gsc.riken.jp@xxxxxxxxxxxxxxx
> [mailto:post-01082104-fumikazu=gsc.riken.jp@xxxxxxxxxxxxxxx]
> On Behalf Of Kuniyasu Suzaki
> Sent: Friday, November 11, 2005 11:55 PM
> To: knoppix@xxxxxxxxxx
> Subject: [knoppix:5759] Re: KNOPPIX for InterProScan4.1 High
> Throughput Computing EditonのＳＣ０５でのリリース
>
>
> 須崎です。
>
> SuperComputing05 で配るのですね。
> http://sc05.supercomputing.org/
>
> 是非ともご本家でもアナウンスして下さい。
> メイリングリスト http://lists.debian.org/debian-knoppix/
> フォーラム http://www.knoppix.net/forum/
> # Ideas なら登録すればだれでも投稿できます。
>
> ところで現在下記サイトは見えないです。落ちているのかな。
> >>詳しくは、 http://big.gsc.riken.jp/index_html/Members/fumikazu/htc
>
> ------
> suzaki
>
> >>From: "Fumikazu KONISHI" <fumikazu@xxxxxxxxxxxx>
> >>Subject: [knoppix:5755] KNOPPIX for InterProScan4.1 High
> Throughput Computing EditonのＳＣ０５でのリリース
> >>
> >>理化学研究所の小西です。
> >>
> >> バイオインフォマテックス分野におけるアプリケーションであるＥＢＩの
> >>InterProScan4.1の実行環境をインスタントに
> >>構築するKnoppixをリリースいたします。
> >>
> >> 主な機能は以下のとおりです。
> >>
> >> １） InterProScan4.1の実行環境がインスタントに構築することができ
る。タ
> >>ンパク質の機能ドメイン検索が実行できる。
> >>
> >> ２） ＰＶＦＳ２によって、クラスター計算機を構成しているワークノー
ド上の
> >>ラムディスクを仮想的に
> >> 統合して、ＩｎｔｅｒＰｒｏＳｃａｎのデータベース（約６Ｇ）を配
置する
> >>ことを可能にした。よって使用ノード数は、
> >> ワークノードが持つメモリサイズに依存します。
> >>
> >> ３）Condorスケジューラを使って、ワークノードにジョブを自動サブミッ
トする
> >>機能を組み込んだ。
> >> （vanila, standard, MPI の各ユニバースが利用可能）
> >>
> >> ４）Ｇａｎｇｌｉａによって、全てのノードの状態を監視できるようにし
た。
> >>
> >> ５）以上の構築を、Ｗｅｂブラウザーから操作できるようにした。
> >>
> >> ６）ワークノードへのイメージの配布は、ＰＸＥブートを使ったネット
ブートで
> >>構築ができるようにした。
> >> 数十ノードであれば、１５分程度で構築が可能。 64ノードまで確認
済み。
> >>
> >> ７）システムを再起動することで、元の計算機に戻せるように留意した。
> >>
> >> ８）産総研のGfarmも収録し、ＰＶＦＳ２の変わりに近日選択できる予定。
> >>
> >> などなどの機能が付加されております。
> >>
> >>
> >> 使っていただきたいユーザ層
> >>
> >> ＊ InterProScanを利用したいバイオ研究者で、クラスターは持ってい
るんだ
> >>けど、自分では設定をしたことは無い人。
> >> ＊ 期日までにどうしても、タンパク質機能ドメイン検索をやりたいん
だけ
> >>ど、クラスターは持っていない。でも、周りに
> >> 使えそうなＰＣや、週末の間だけ貸してもらえそうな計算機がある
人。
> >> ＊InterProScanには興味があるんだけど、自分の計算機にインストール
してま
> >>では試したくない人。
> >>
> >>
> >>配布情報
> >>
> >>
> >>11月12日からシアトルで開催されるSC05にて、本システムのイメージＣＤの配
布を行
> >>います。
> >>日本でのＣＤ配布と、イメージの配信は、ＣｏｎＳＹＳ２００５での関連発表
後に開
> >>始できるように準備しております。
> >>
> >>詳しくは、 http://big.gsc.riken.jp/index_html/Members/fumikazu/htc
> >>
> >>
> >>理化学研究所 横浜研究所 ゲノム科学総合研究センター(GSC)
> >>ゲノム情報先端技術研究グループ広域分散情報統合研究チーム
> >>研究員 小西史一 博士（工学）
> >>〒230-0045 神奈川県横浜市鶴見区末広町1-7-22
> >>tel:045-503-9602, fax:045-503-9559
> >>mailto:fumikazu@xxxxxxxxxxxx
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